Dal 1994 al 2003 la Fondazione ha assegnato il prestigioso “Premio Fondazione Romeo ed Enrica Invernizzi” a studiosi e ricercatori italiani che operavano nei campi dell’Economia e delle Scienze Alimentari. Dal 1997 il premio è stato esteso anche alla Medicina.
La scelta dei premiati veniva svolta dal Comitato Generale Premi (art. 14 dello Statuto) composto di nove membri di rinomanza internazionale, scelti dal Consiglio di Fondazione fra illustri cultori delle scienze e delle arti.
Dal 2004, i tre premi sono stati convertiti in erogazioni alla ricerca nelle medesime aree scientifiche.